יונתן, בנם הבכור של מיר ויוסי, נולד בשעות הצהריים המוקדמות ביום 3 ליוני 1985, בבית החולים העמק אשר בעמק יזרעאל. גדל, התחנך והתבגר בקיבוץ מרחביה. יונתן היה הבכור במשפחה ולימים נוספו לתא המשפחתי וליונתן שתי אחיות - שרון ועדן.

כבר בילדותו המוקדמת התבלט יונתן בשובבותו הגדולה ובחן אישיותו. כמנהיג טבעי הוביל את חבריו למעשי שובבות אבל כמו בהמשך חייו, היו אלה תמיד בגבול הטעם הטוב. מגן הילדים עברו יונתן וחבריו לבית-הספר היסודי שבקיבוץ מרחביה, ומשם למוסד החינוכי "עמקים" אשר בקיבוץ מזרע. יונתן היה תלמיד טוב אולם את עיקר מאמציו הפנה לחיים החברתיים, ספורט ומוזיקה. אהבתו הגדולה של יונתן למוזיקה ניכרה מגיל צעיר. כבר בגיל עשר החל ללמוד לנגן בגיטרה קלאסית ובהמשך עבר לנגן רוק על גיטרה חשמלית, ולעתים, כדי לגוון, היה גם מתופף בתופים. פרט לכישרונו המוזיקלי, גילה יונתן הצטיינות יתרה גם בספורט. הוא שיחק בקבוצת הילדים של "הפועל מגדל העמק" בכדורגל, וכן הצטיין בריצות ארוכות.

יונתן התאפיין בלב רחב, בנועם הליכות ובצניעות גדולה. הוא נהנה מחיי חברה שוקקים ובמנהיגותו השקטה סחף אחריו את חבריו בשכבה לפעילויות שונות. תמיד היה מוקף בחברים ובחברות שהעריכו אותו וידעו כי הוא נועד לגדולות. אדם חם ואוהב היה שידע לחלק בתבונה את זמנו בין חיי המשפחה, הזוגיות והחברים. כינויו, כפי שנכתב בספר המחזור, היה "הגבר".

בסוף חודש נובמבר 2003 התגייס לצה"ל והצטרף ליחידת "מגלן". במהלך המסלול שמר על אופטימיות גדולה והיה נחוש לסיימו על אף הקשיים. בתקופת ההכשרה וגם לאחריה השתתף יונתן בפעילויות מבצעיות, ועל כך נהג לומר "יש עבודה לעשות ומישהו צריך לעשות אותה". ביום העצמאות החמישים ושמונה למדינת ישראל קיבל יונתן תעודת הצטיינות יחידתית על תרומתו ליחידה ועל מצוינות אישית ומקצועית. בטקס שהתקיים ביחידה ציין מפקד היחידה אל"מ אמיר ברעם את נחישותו ואומץ לבו של יונתן בהובלת צוותו ויחידתו להישגים במלחמה המתמשכת מול ארגוני הטרור.

ביולי 2006, כאשר פרצה מלחמת לבנון השנייה, עלה יונתן עם יחידתו לגבול לבנון. בבוקר יום 19 ליולי 2006 יונתן נהרג בהיתקלות עם מחבלי חיזבאללה במהלך קרב על הגנת יישובי הצפון מירי רקטות.

יונתן הובא למנוחות בבית העלמין בקיבוץ מרחביה, כשמאות מלווים אותו בדרכו האחרונה.

יונתן, בן עשרים ואחת בנופלו, הותיר אחריו הורים, שתי אחיות, משפחה מורחבת בארץ ובחו"ל, חברים רבים, והרבה רגעים וזיכרונות טובים שיישארו אתנו לעד.